Pengusulan Thomas Djiwandono sebagai calon Deputi Gubernur BI bukan usul dari Prabowo, melainkan Gubernur BI sendiri. Wakil Ketua DPR RI Sufmi Dasco Ahmad mengatakan nama-nama calon pengganti Deputi Gubernur ini tidak berasal dari Presiden, tetapi dari Gubernur BI Perry Warjiyo yang mencari pengganti untuk salah satu Deputi Gubernur yang mengundurkan diri.